Pathologie moléculaire

• Coupe au microtome de tissu en paraffine  
• Coupe au cryostat de tissu frais ou en composé OCT 

CHUM

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• Coloration à l’hématoxyline et à l’éosine (H&E)
• Coloration en immunohistochimie et en immunofluorescence avec l’automate Ventana de Roche
• Coloration en immunofluorescence cyclique à haut débit à l'aide de l'appareil COMET de Lunaphore

Combinées ou non à la coupe de tissus, les colorations de type H&E servent à identifier les différentes parties du tissu (p. ex. : stroma, épithélium) et seront effectuées de façon automatisée par le colorateur. 

Nous utilisons un préparateur/colorateur automatisé Ventana pour le marquage de lames en immunofluorescence ou en immunohistochimie. L’automatisation augmente grandement la reproductibilité et la fiabilité des résultats d’immunohistochimie. 

L'appareil COMET permet un marquage séquentiel utilisant une technologie microfluidique pouvant hybrider jusqu'à 40 marqueurs sur une même lame en immunofluorescence.

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• Analyse d’images numérisées de lames à l’aide du logiciel VIS de Visiopharm. 

La plateforme est dotée de deux licences du logiciel VIS, un logiciel d’une grande puissance pour l’analyse d’images en immunohistochimie et en immunofluorescence. 

• Tissus congelés frais (avec ou sans OCT)  
• Tissus inclus en paraffine  
• Sang ou cellules 

• Dosage et contrôle de la qualité des échantillons d’ADN (DIN) et d’ARN (RIN) avec seulement 1 µL d’échantillon au TapeStation  

• Inclusion de tissus en bloc de paraffine 
• Création de blocs de culots de cellules 
  
  
  
  Les cellules en cultures peuvent être fixées à la formaline puis incluses dans un culot d’histogel, qui est ensuite enrobé dans la paraffine (en pathologie) pour former un bloc. Les cellules peuvent ainsi être analysées en TMA ou être directement marquées par immunohistochimie.

• Tissus humains ou de souris 
• Culots de cellules 
• Carottes d’un diamètre de 0,6 mm, 1,0 mm ou 1,5 mm 
  
  
  
  Les carottes sont prélevées d’un bloc de paraffine à l’aide du tissu arrayer et insérées dans un tube pour analyse RNAseq ou autres. 

Les TMAs permettent de regrouper une grande cohorte de patients sur un même bloc de paraffine, en prenant des carottes de tissus d’intérêt et en les rassemblant sur un nouveau bloc de paraffine de façon ordonnée.

La plateforme prépare des TMAs à partir d’une grande diversité de tissus. Les carottes peuvent être de 0,6 mm, 1,0 mm ou 1,5 mm de diamètre. L’approche facilite les études immunohistochimiques d’une cohorte en réduisant le nombre de lames à marquer, les coûts d’anticorps, le temps de marquage et le temps d’analyse. 

Le personnel de la plateforme offre des conseils sur la spécificité d’anticorps, la qualité d’un marquage ou l’analyse de micro-étalages de tissus.

• Lecture de lames histopathologiques humaines et animales 
• Interprétation, conseils et orientation en immunohistochimie et immunofluorescence 
• Conseils pratiques en macroscopie humaine et animale 
• Rédaction de paragraphes pour demandes de fonds et articles 
• Formation et prise en charge d’étudiants en histologie 
• Accès au savoir histologique