Métabolomique

La plateforme de métabolomique effectue des dosages quantitatifs ou semi-quantitatifs de groupes de métabolites ciblés.

Elle offre aussi la possibilité d’utiliser des instruments en libre-service.

Nos services sont disponibles pour les chercheurs des milieux universitaires, hospitaliers et industriels.

Dosage de métabolites

• Acides gras à courte chaîne (10 métabolites)Analytes : acides acétique, propionique, butyrique, isobutyrique, valérique, isovalérique, caproïque, lactique, succinique et le 3-hydroxypropanal.
  
  Matériel : selles (≥10 mg); plasma (100 µL)
  
  Quantification : analyse quantitative¹
• Acides biliaires (13 métabolites)
  
  Analytes : acides cholique (CA), désoxycholique (DCA), chénodésoxycholique (CDCA), ursodésoxycholique (UDCA), glycodésoxycholique (GDCA) glycoursodésoxycholique (GUDCA), taurocholique (TCA), taurodésoxycholique (TDCA), taurochénodésoxycholique (TCDCA), lithocholique (LCA), α-, β- et ω-muricholique (αMCA, β-MCA et ω-MCA)
  
  Matériel : selles (≥10 mg); plasma (100 µL)
  
  Quantification : analyse quantitative¹
• Métabolisme central du carbone (35 métabolites)
  
  Analytes : AMP, ADP, ATP, adénosine, GMP, GDP, GTP, NAD, NADH, NADP, NADPH, cAMP, cGMP, acétyl-CoA, malonyl-CoA, acétoacétyl-CoA, HMG-CoA, citrate/isocitrate (non discriminés), malate, succinate, alpha-cétoglutarate, fumarate, oxaloacétate, lactate, pyruvate, acétoacétate, leucine, glutamine, glutamate, aspartate, arginine, glutathion oxydé, glutathion réduit, DHAP, glycérol-3-phosphate
  
  Matériel : tissu (≥10 mg); cellules en culture (106)
  
  Quantification : analyse relative²
• Acides aminés (23 métabolites)
  
  Analytes : alanine, arginine, asparagine, carnitine, citrulline, cystine, glycine, glutamate, glutamine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, méthionine, ornithine, phénylalanine, proline, sérine, taurine, thréonine, tryptophane, tyrosine, valine
  
  Matériel : plasma (10 µL); tissu (≥10 mg); (cellules en culture (106)
  
  Quantification : analyse relative² ou semi-quantitative¹
• Neurotransmetteurs (10 métabolites)
  
  Analytes : acétylcholine, adrénaline, noradrénaline, dopamine, GABA, glutamate, glycine, tryptophane, 5-hydroxytryptophane, sérotonine
  
  Matériel : plasma (20 µL); tissu (≥10 mg)
  
  Quantification : analyse relative²
• Trousse Biocrates MxP® Quant 500 (630 métabolites)
  
  Analytes : voir https://biocrates.com
  
  Matériel : plasma (10 µL)
• Développement de méthodes personnalisées
  
  Exemples de méthodes développées : sphingosine-1-phosphate dans des îlots de Langerhans; acide kaïnique dans des embryons de poisson-zèbre; dNTPs dans des lymphocytes T triés (FACS)
  
  Matériel : plasma; tissu; cellules en cultures; selles; milieux de culture

Utilisation d’instruments

Utilisation en libre-service d’un système HPLC équipé d’un détecteur d’absorbance (UV/Vis), d’un détecteur de fluorescence et d’un collecteur de fractions.

Utilisation supervisée d’équipements spécialisés pour préparer des échantillons.

¹ Résultats exprimés en quantité absolue (par ex. : nmol/mg de matériel) calculée à l’aide d’une courbe d’étalonnage. L’analyse est semi-quantitative lorsqu’un seul ou quelques standards internes sont utilisés. L’analyse est quantitative lorsqu’un standard interne est ajouté pour la plupart ou la totalité des analytes d’intérêt.

² Résultats exprimés de façon relative à une condition contrôle ou en pourcentage du maximum mesuré.